Из известной немецкой семьи, принявшей подданство Российской империи. Окончил Пажеский корпус по 1-му разряду (1896—1902). Служил в Кавалергардском полку в звании корнета. В 1907—1909 учился в Николаевской академии Генерального штаба. В своей усадьбе Сенница (Рязанская губ.) создал домашний музей естественной истории (гербарий, коллекция минералов, зоологическая, орнитологическая и палеонтологическая коллекции), часть материалов которого находится ныне в Государственном геологическом музее им. В.И. Вернадского РАН в Москве и в Историко-архитектурном, художественном и археологическом музее «Зарайский кремль». Увлекался нумизматикой, коллекционировал оружие и предметы декоративно-прикладного искусства. В 1912 окончательно оставил военную службу, поселился в Сеннице, откуда изредка выезжал в Европу. Участник Первой мировой войны (полковник, в составе Чеченского конского полка Кавказской туземной дивизии). Осенью 1918 бежал из Петрограда, поселился в Стокгольме (Швеция), с декабря 1920 — во Франции. Жил в Париже, служил в банке (1920—1927), масон. Участвовал в работе русских эмигрантских комитетов Лиги Наций. С 1928 работал в британской нефтяной компании в Ираке, затем вел геолого-морфологические исследования Сирийской пустыни (район Джазира на левом берегу Евфрата), автор статьи об этом. В дальнейшем жил во Франции.

Похоронен на кладбище в Сент Женевьев де Буа.

Отец: Федор Эдуардович (1850—1904), генерал-лейтенант, директор Пажеского корпуса, губернатор Екатеринославской губернии, погиб во время Русско-японской войны. Мать: Мария Александровна (ур. княжна Шаховская, во 2-м браке фон Флотов; 1861—1944), в эмиграции в Италии. Сестра: Мария (1884—1894). Жена: в 1-м браке — Ирина Владимировна (ур. Скарятина; 1888—1962); во 2-м — Нина (ур. Крузенштерн). Дети: Федор (1908—1911); Мария (1910—2003), служащая страховой фирмы, в эмиграции во Франции; Анна (1919—1988, в зам. Ратман).

Фотография захоронения предоставлена партнером нашего проекта Оксаной В. Компаниец (Франция), выражаем ей искреннюю благодарность.

Лит.: Ковалевский П.Е. Наши достижения. Роль русской эмиграции в мировой науке. Вып. 1. Мюнхен, 1960. С. 15. Ковалевский П.Е. Зарубежная Россия. Париж, 1971. С. 131; Серков А.И. Русское масонство. 1731—2000: энциклопедический словарь. М., 2001. С. 386; Лялин С.П., Минина Е.Л. История усадьбы Сенницы // Русская усадьба: Альманах. 2004. Вып. 9. М., 2004. С. 498—507; Российское зарубежье во Франции: 1919—2000: биографический словарь. Т. 1. М, 2008. С. 677; Грезин И.И. Алфавитный список русских захоронений на кладбище Сент-Женевьев-де-Буа. М., 2009. С. 228; Геологи российского зарубежья: судьбы и вклад в мировую науку / ред.-сост. П. Чумаченко, О. Дитл. София, 2014. С. 110, 123—124; Минина Е.Л. Граф Е.Ф. Келлер и его минералогическая коллекция. М., 2015; Skariatina I. A World Can End. New York, 1931; Skaryatina I. First To Go Back: An Aristocrat in Soviet Russia. New York, 1933.

Некр.: Шереметев Д.А. Памяти брата А.Ф. Келлера // Русский вольный каменщик. Париж, 1946. № 2. C. 21.