Окончил 2-ю киевскую классическую гимназию, учился на естественном отделении физико-математического факультета Университета св. Владимира в Киеве. В конце 1916 призван на военную службу, зачислен в Киевское военно-инженерное училище (1916—17), выпущен прапорщиком. Участник Белого движения в Вооруженных силах юга России. Эвакуирован из Крыма в Галлиполи в составе Русской армии генерала П.Н. Врангеля в ноябре 1920. Затем жил в Королевстве сербов, хорватов и словенцев. Работал на строительстве железной дороги в районе г. Косовская Митровица, учителем в гимназии. В 1922 переехал в Прагу (Чехословакия). Учился, затем преподавал в Карловом университете. Доктор наук (1924). Работал в лаборатории Института физиологии растений под руководством Б. Немеца. Специализировался на анализе ядра растительной клетки. Стипендиат Рокфеллеровского фонда (1927—28). Приглашен на работу в Институт Пастера (Париж, Франция), но вскоре вернулся в Прагу. Приват-доцент Карлова университета (с 1929). Член Совета преподавателей Русского народного университета, Русской академической группы (1935—39). Во время гитлеровской оккупации, оставаясь в Праге, служил агрономом. Член Совета Русской ученой академии (1944). После Второй мировой войны профессор Института физиологии растений, доктор наук. Член Чехословацкого ботанического общества, Общества гистологов и цитологов Чехословацкой академии наук. Награжден медалью Г. Менделя.

Похоронен на Ольшанском кладбище в Праге.

Отец: Филипп Александрович, чиновник ведомства народного просвещения. Мать: Ольга Александровна (ур. Мейнгард; 1868—1953). Братья: Филипп и Андрей, математик и филолог, расстреляны большевиками в 1919; Петр, арестован в 1935 в Киеве, погиб в заключении. Жена: Елена Евгеньевна (ур. фон Колен; 1899—1989). Дочь: Нина (1926—2014), историк литературы.

Библ.: Материалы для библиографии русских научных трудов за рубежом (1920—1930) / Под ред. Е.В. Спекторского. Т. 1. Белград, 1931. № 251. С. 210—212; Труды русской, украинской и белорусской эмиграции, изданные в Чехословакии в 1918—1945 гг. Прага, 1996. Т. 1. Ч. 2. С. 472—473.

Соч.: Sur la question de 1'existence des chimeres periclinales des plantes panachees // Ученые записки, 1926. C. 33—74; Physik und Chemie des Zellkernes. T. 1—2. Berlin, 1949—1952.

Лит.: Ковалевский П.Е. Наши достижения: Роль русской эмиграции в мировой науке. Вып. 1. Мюнхен, 1960. С. 20; Ковалевский П.Е. Зарубежная Россия: История и культурно-просветительная работа русского зарубежья за полвека (1920—1970). Париж, 1971. С. 140; Хроника культурной, научной, и общественной жизни русской эмиграции в Чехословацкой республике / Под ред. Л.Н. Белошевской. Т. 1—2. Прага, 2000—2001; Сухарев Ю.Н. Материалы к истории русского научного зарубежья. Кн. 1. М., 2002. С. 315; Чичерюкин-Мейнгардт В.Г. Миловидов Петр Филиппович (1896—1974) // Новый исторический вестник. 2004. № 2; Ульянкина Т.И. Спасение ученых от нацизма в 1933—1941 гг.: Беженский университет Э. Джонсона и Толстовский фонд (Нью-Йорк) // Вопросы истории естествознания и техники. 2007. № 4.. С. 93; Дом в изгнании: очерки о русской эмиграции в Чехословакии, 1918—1945. Прага, 2008. С. 115—118; Российское научное зарубежье: Материалы для биобиблиографического словаря. Пилотный вып. 6: Естественные науки. XIX — первая половина ХХ в. / Сост. М.Ю. Сорокина. М., 2011. С. 216—217; Российское научное зарубежье: Биобиблиографический справочник / Сост. М.Ю. Сорокина. М., 2011. С. 426—427; Beneš K. Professor Peter F. Milovidov // Biologia Plantarum. July 1975. Vol. 17, Is. 4. Р. 241—242.