Эмигрировал из Одессы в Вену (Австрия) в 1920. В 1931—36 изучал медицину в Венском университете. Доктор медицины (1936). Член коммунистической партии. В 1937—50 жил в США. С 1938 занимался исследовательской работой в детском госпитале (Цинциннати; шт. Огайо). Во время Второй мировой войны специализировался на проблемах консервации крови. В 1950, после получения известия о возможности преследования со стороны Комиссии сенатора Маккарти, не вернулся в США из поездки на конгресс в Цюрих (Швейцария). Недолго работал в Институте медицинской химии в Вене. С 1951 профессор университета им. Гумбольдта (Берлин; ГДР). С 1952 основатель и директор Института биохимии университета. Автор более 600 научных работ. Действительный член Академии наук ГДР (1968).

Похоронен на кладбище Панков 3 в Берлине.

Жена: Ингеборг Силлм (р. 1912), врач. Сыновья: Том, биохимик, сотрудник Гарвардского университета; Майкл, математик, сотрудник Боннского университета. Дочери, медики.

Восп.: Die Erfahrungen des Exils (http://www.inst.at/trans/15Nr/plenum/rapoportl15DE.htm).

Лит.: Российская еврейская энциклопедия. М.,  1995. Т. 2. С. 443; Marxismus, Exil und jüdische Identität. Der Biochemiker Samuel Mitja Rapoport // Jüdisches Echo. 2000, October. № 49. Р. 337—345; Rapoport I. Meine ersten drei Leben. Berlin, 2002; Schönfeld Th. Samuel Mitja Rapoport (1912—2004). In memoriam // Mitteilungen der Alfred Klahr Gesellschaft. 2004. № 3; Jacobasch G., Rohland L. (Hrsg.) Samuel Mitja Rapoport (1912—2004). Berlin, 2005.

Некр.: British Medical Journal. 2004. Vol. 329. 7 august.