Окончил гимназию в Бердянске (1879), естественное отделение физико-математического факультета Новороссийского университета в Одессе (1879–1884). Ученик И.И.Мечникова. Участник студенческого революционного движения, группы самообороны во время еврейских погромов (1881), член партии «Народная воля». Сотрудник Одесского зоологического музея. С 1888 — в Швейцарии, в 1889-1893 — во Франции, служил в Пастеровском институте в Париже: библиотекарь, ассистент лаборатории технической микробиологии проф. Э. Ру. Доктор естественных наук (1892). Разработал эффективную вакцину против холеры (1892), испытал ее на себе и потом широко применял в Индии во время эпидемий (1893—95). Создал вакцину («лимфа Хавкина») против чумы (1896), позволившую резко снизить смертность во время эпидемий (1896—1902). В английской медицинской литературе появился специальный термин «хавкинизация», пресса называла Х. «великим филантропом», «благодетелем человечества». В 1893—15 (с перерывом в 1904—07) по приглашению правительства Великобритании работал в Индии по иммунизации населения. Государственный бактериолог индийского правительства (1893—1904). Директор созданной по его инициативе противочумной лаборатории в Бомбее (1896—1904). Подвергался травле в газетах за якобы вредное воздействие прививок на человека. В 1907—15 работал в Калькутте. С 1915 жил во Франции (Boulogne-sur-Seine). Участник сионистского движения. С 1927 жил в Швейцарии (Лозанна). Основатель благотворительного фонда для поддержки еврейского образования (1928—30). Автор научных работ по проблемам изменчивости и адаптации микроорганизмов. Премия Парижской медицинской академии (1909).

Фото захоронения предоставлено Aleksandr Duel, которому приносим нашу благодарность.