Окончил Усть-Сысольское уездное училище (1879), Тотемскую учительскую семинарию (1884). Учился в Санкт-Петербургском лесном институте, на физико-математическом и историко-филологическом факультетах Университета св. Владимира в Киеве (1896—99), историко-филологическом факультете Санкт-Петербургского университета. Окончил в 1901 с дипломом 1 степени; оставлен для подготовки к профессорскому званию. В 1902 защитил магистерскую диссертацию «О грамматическом строе зырянского языка». Занимался изучением быта и древностей народов Севера России, изучал угро-финские языки. С 1908 приват-доцент, затем профессор логики СПб. Психоневрологического института В.М. Бехтерева (до 1917). В 1912 побывал в Японии, стремясь доказать родство японского и финно-угорских языков. В 1918—19 преподавал во Псковском педагогическом институте. В 1919—21 профессор философии Тартуского университета (Эстония). В 1921 переехал в Валгу (Латвия), затем в Ригу.

Похоронен на Покровском кладбище, перезахоронен в 1990 в Сыктывкаре (Коми).

Жена: во 2-м браке — Глафира Никаноровна (ур. Николаевская; ум. 1942); дочь: Евгения (1901), сын: Вадим (1903—1937); в 3-м браке — Алида Каролина Приеде (1893—1941); дочери: Райда (1918—1996), Елена (1920—1986).

Все фотографии предоставлены С.Ковальчук (Рига), приносим благодарность.

Соч.: Сквозь строй жизни. Т. 1—4. СПб., 1912—1914.

Лит.: Белоконь С. Зырянский Фауст // Даугава. 1988.  № 5. С. 112—124; Абызов Ю.И. Русское печатное слово в Латвии 1917—1944. Биобиблиографический  справочник. Stanford, 1990.  T. 2. С. 72—74; Сорокин П.А. Долгий путь. Сыктывкар, 1991; Петрицкий В.А. Вехи времени. (Рукописи и инскрипты деятелей культуры русского зарубежья в частном собрании). СПб., 1995. С. 31; Шор Т. Личные архивные фонды русских деятелей в эстонских архивохранилищах // Балтийский архив. Т. 1. Таллинн, [1996]. С. 11—12, 24; Ковальчук С.Н. «Взыскуя Истину …»: Из истории русской религиозной, философской и общественно-политической мысли в Латвии: Ю.Ф. Самарин, Е.В. Чешихин, К.Ф. Жаков, А.В. Вейдеман. (Середина XIX в. — середина  XX в.). Рига, 1998; Покровское кладбище. Слава и забвение: Сборник статей / Сост. С. Видякина, С. Ковальчук.  Рига, 2004; Танклер, 2005. С. 68—69; Акименко М.А. Институт имени В.М. Бехтерева: от истоков до современности (1907—2007 гг.). СПб., 2007. С. 20; Шор Т.К. Каллистрат Жаков и Тартуский университет // Реальность этноса. Педагогическое образование как важнейший фактор сохранения и развития культуры северных народов. Сборник статей по материалам IX Mеждународной научно-практической конференции, посвящённой 210-летию РГПУ им. А.И.Герцена. СПб., 2007. C. 167—172; Ковальчук С.Н. Рижский архив Калистрата Жакова // Россия и Балтия Вып. 5: Войны, революции и общество. М., 2008. С. 185–210; Российское научное зарубежье: Материалы для биобиблиографического словаря. Пилотный вып. 3: Востоковедение. XIX — первая половина ХХ в. / Сост. М.Ю. Сорокина. М., 2010. С. 85; Российское научное зарубежье: биобиблиографический справочник / Ред.-сост. М.Ю. Сорокина. М., 2011. С. 271.

Некр.: Незабытые могилы. Российское зарубежье: Некрологи 1917—1997: В 6 т. / Сост. В.Н. Чуваков и др. М., 1999. Т. 2. С. 516.